c-Kit 是一種 III 型受體酪氨酸激酶 (RTK)，在癌癥發(fā)生中起著至關(guān)重要的作用。目前，c-Kit 主要被認(rèn)為是一種干細(xì)胞因子（SCF），它參與人體的重要功能，如生育、體內(nèi)平衡和黑色素生成；盡管如此，對(duì) c-Kit 的早期研究將其作為致癌基因引入。c-Kit 的失調(diào)，包括過(guò)度表達(dá)和功能獲得突變，已在幾種人類疾病中檢測(cè)到。比如斑狀白化病（Piebaldism）、胃腸道間質(zhì)瘤（GIST），系統(tǒng)性肥大細(xì)胞增多癥（Systemic mastocytosis），急性髓性白血病（acute myeloid leukemia）等等。

c-Kit是4號(hào)染色體長(zhǎng)臂區(qū)域 (4q11-4q13) 中的一種原癌基因，編碼 SCF 受體 (CD117)，由五個(gè) IgG 樣細(xì)胞外結(jié)構(gòu)域、一個(gè)跨膜螺旋和一個(gè)自身抑制性近膜 (JM) 結(jié)構(gòu)域和一個(gè)細(xì)胞質(zhì)結(jié)構(gòu)激酶域組成。

c-Kit的信號(hào)通路

c-kit涉及多種信號(hào)通路，主要涉及Ras- Erk Pathway, PI3K/AKT pathway和Src-signaling pathway。雖然每條信號(hào)通路通過(guò)不同的途徑，對(duì)細(xì)胞功能的影響也不同，但三種途徑的結(jié)果都是抑制細(xì)胞凋亡，以不同的方式導(dǎo)致腫瘤發(fā)生，如誘導(dǎo)細(xì)胞增殖、生長(zhǎng)進(jìn)程。

圖1.  c-Kit相關(guān)的信號(hào)通路

c-Kit的常見(jiàn)突變

迄今為止發(fā)現(xiàn)了許多Kit突變位點(diǎn)，并且在不同的癌癥類型中有所不同，反映了每個(gè)突變對(duì)下游信號(hào)通路的影響。Kit基因中的一些“熱點(diǎn)"在某些主要域結(jié)構(gòu)中是有規(guī)律的。比如胞內(nèi)和胞外juxtamembranes，位于外顯子8，9以及外顯子17，其對(duì)應(yīng)于在激酶結(jié)構(gòu)域活化環(huán)，這些突變破壞了c-Kit的自抑制效應(yīng)。

圖2.  常見(jiàn)的c-Kit的突變


c-Kit的診斷

根據(jù)NCCN指南描述：約80%的GISTs在酪氨酸激酶受體編碼基因KIT存在突變，當(dāng)具有外顯子11突變時(shí)，將近90%的患者可從伊馬替尼治療中獲益；外顯子9突變時(shí)，近50%的患者可從伊馬替尼治療中獲益。

在AML的指南中，描述大約有20%的CBF（core binding factor） AML 患者存在 KIT 突變，推薦的分子檢測(cè)包括c-KIT, FLT3 [ITD and TKD], NPM1, CEBPA (biallelic), IDH1, IDH2, TP53, and other mutations。

標(biāo)準(zhǔn)品

科佰生物作為一家專業(yè)提供分子診斷標(biāo)準(zhǔn)品的公司，提供關(guān)于c-kit多種常見(jiàn)突變形式的產(chǎn)品（gDNA、RNA、ctDNA、FFPE等等），涉及多種技術(shù)平臺(tái)，對(duì)整個(gè)流程做質(zhì)控管理，也適合LDT和IVD的開(kāi)發(fā)驗(yàn)證。

表1. 常見(jiàn)c-kit突變的分子診斷標(biāo)準(zhǔn)品

部分?jǐn)?shù)據(jù)展示



圖3. c-KIT p. A502_Y503dupwith sanger sequencing

圖4. c-Kit p.V560D with sanger sequencing

圖5. c-Kit p.D816Vwith sanger sequencing


c-Kit突變藥物研發(fā)

自然狀態(tài)下，c-Kit的催化活性是保持自動(dòng)抑制的，直到配體SCF結(jié)合，啟動(dòng)c-Kit的同源二聚體，c-Kit單體重排，JM結(jié)構(gòu)域解除自動(dòng)抑制狀態(tài)，A環(huán)從非活性位置切換到激活位置。我們常見(jiàn)的c-kit突變往往是在不需要配體SCF結(jié)合的前提下，直接導(dǎo)致c-Kit的二聚化和激活。

伊馬替尼是針對(duì)可切除的原發(fā)性 GIST 患者以及那些不可切除或晚期轉(zhuǎn)移性 GIST患者作為一線治療藥物獲批，這些突變一般是由Exon11引起。但是一線治療誘導(dǎo)獲得性次級(jí)突變主要出現(xiàn)在Exon13/14和17中，這些突變會(huì)直接活化A環(huán)，進(jìn)而對(duì)包括伊馬替尼在內(nèi)的許多抑制劑不敏感。

圖6. 常見(jiàn)c-Kit的抑制劑

藥物靶點(diǎn)模型

針對(duì)c-Kit及其常見(jiàn)的耐藥位點(diǎn)，科佰生物開(kāi)發(fā)了多種cell-based kinase assay模型，可以用于TKI的in vitro和in vivo的活性檢測(cè)，適合早期的化合物測(cè)活篩選，也合適后期的產(chǎn)品放行QC。

部分?jǐn)?shù)據(jù)展示